180年后,到了公元2356年,人类在地球、火星、土星、木星等各行星上都建立了巨大的宇宙基地,而为了在这些宇宙基地间建立有效的联络,在各行星之间还建立了许多太空站。在其中的一座空间站上有一座名叫“星之路”的宇宙学院,这座学院的任务就是培养有能力完成特殊任务的少年宇航员。本作的主人公片濑志麻就是这座学院中的一名学生。刚进入学院,片濑志麻和其他学员一样对新的学习生活很不适应,但同龄人之间的友情使大家都得到了不小的帮助,生活也渐渐进入正轨。片濑志麻还认识了一个名叫音山光太的男孩,两人很快就成为了好朋友。而且,一种朦胧的恋情也渐渐的在他们之间产生。平静的生活并没有维持多久,学员们开始接受严酷的训练,更有关系到地球存亡的重大任务让他们去完成,志麻和他的同学们能经受住这样的考验吗?
科学警备队队员光超一郎从宇宙空间站EGG3前往地球的途中与不明宇宙人遭遇,自称为"奥特曼"的宇宙人告诉他地球上的各种怪兽与超自然现象危机迫在眉睫,但奥特曼无法以宇宙人的身姿在地球上长期生活,所以便借用光超一郎的身体与之合为一体,并可以用"闪光之星"来随时变身,使人类得以应付即将到来的各种危机…作为奥特曼系列的动画版,比起特摄片有固有的优势。在这里,主角可以做以前奥特曼们无法完成的特技。同时在一话中可以有数个奥特曼和怪兽登场,而不用额外的开销。而且,怪兽的设计者们不用再被这个时代"怪兽的皮套需要适应人的体型"这一技术条件所限制。因此,他们的创造力可以无限发挥。