在跟随人类的脚步走出太阳系,殖民地球以外的行星之后,宇宙中逐渐出现了许多独立的行星状态。为了维持基本秩序,防止星际摩擦升级为宇宙战争,独立的行星政府达成协议,成立了一个类似于联合国的组织——“宇宙行星联盟”,以确保全人类的安全、自由与和平。
为了寻找自己命运的线索,埃克斯踏上了旅途。 身世神秘的调音巫女蕾娜(上田丽奈 配音)、好爽奔放的强壮青年塔奥(江口拓也 配音)、我行我素不拘小节的少女诗音(久保田未梦 配音),一路上,埃克斯遇到了很多拥有异常生命之书的旅伴们,在结伴而行的过程中结下了深厚的友谊。