加纳神一（由华江夏树配音）是一个真正的宅男。在他的第一次告白被拒绝后，深一开始了一段深刻而极简的宅男生活。然而，一直呆在家里并不是一个解决办法。考虑到这个想法，申一决定出去工作。在一次可疑的采访后，申一出人意料地成为了“安慕克掌门人”。
故事发生在时空的未来，狗流感的爆发导致市长（野村配音）颁布了一项狗流放法，将城市中的所有狗都安置在一个“垃圾岛”上，并允许它们自己生存，市长的护卫犬点点（Levy Schreiber饰演）首当其冲。
某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 理树则开始了寻找成员的任务。 在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 经历了许多快乐的事情， 同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。 ——然而，这并不是结束。 和来谷唯湖之间的故事。 理树与铃的故事。 以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。 Little Busters真正的物语，自此开始——。
