《暮光之城》的故事开始于昭和58年的1983年6月。男主人公前原圭一搬到了一个人口不到2000人的小镇西泽村，开始了新的生活。在这里，他遇到了Ryomiya Ryuna、元崎美音、北条贞子和石川久守等同学，并成为了俱乐部的朋友。
很快，世界各地建立了名为“花园”的专门学校来培养百合，每一所学校都有自己的名字和特点。我们的女主人公，一流莉莉（红尾灯修炼），就读于莉莉山女子学院。在学校里，李莉遇到了这些并肩作战的同伴，包括冷酷而个人主义的角色白静梦洁（白木洋子配音）、金汤匙出生的女儿努维尔（井上和子配音）和拥有非凡智慧和渊博知识的二川二水（日本良美配音）。
Fujinuma Wu（由Manjima Masuke配音）有一种特殊的能力，可以回到过去。他的母亲Takayama Satoko被谋杀，他曾经信任的朋友Shiro Run（三岛大辅配音）即将作为一系列儿童谋杀案的罪犯被处决。
