尽管形势极为悲观,但三伦园仍然没有放弃希望,启动了“萤火虫繁殖计划”,希望通过这一行动加深师生之间的联系。奇奇(丽莎·坎饰演)在一个破碎的家庭中长大,性格非常孤独和冷漠。然而,她相信,只要她能释放萤火虫,她就能找回失去的母爱。
在一所远离城市喧嚣的女子高中,四个月大的老师佐佐子(宫田康树饰演)不得不板着脸管教放纵的孩子,而女孩的父母偶尔会打电话抱怨,这阻碍了正常的教学工作的顺利进行。叛逆的美月(小林翔之饰演)长期以来一直不服从根阳座及其追随者的管教。
然而,在大冢村事件中获得特殊能力的希娜和庄杰,却因不明原因被帝国教会总部搜查。大冢村事件发生五年后,信乃和庄杰所在的教会总部终于找到了。为了引诱两人前往帝都,他们出乎意料地带走了宾鲁