从今天起，有点天然呆的灯里（三上枝织 配音）正式成为一名初中生，开学第一天灯里加入了好友京子（大坪由佳 配音）和结衣（津田美波 配音）所在的“娱乐部”。
绝对不相信有超自然力量存在的玛雅，此行便是为了调查父亲里奇的死因而来，这样的她，遇见了一位名叫内田文明（水岛大宙 配音）的神秘男子，刚刚登场的内田，便说出了让玛雅吃惊的话语，他居然来自未来的2012年！ 这个形迹可疑的男子的话能够相信吗？2012年的世界是怎样的景象？一连串意外让玛雅逐渐相信了内田的说辞，而内田究竟为何而回到过去，这原因也渐渐的浮出了水面。
在10年后东牧城爆发的“圣杯之战”中，由于被称为“圣杯战争”之一的关东家首领关东脏砚的参与，这场战争变得更加变形、扭曲和恶化。作为参与战斗的宫主，卫宫侍郎也受伤了，失去了英雄Saber。然而，为了保护小樱，侍郎并没有退出战斗。而为四郎的身体感到担忧的小樱，也逃不过魔术师自己的命运
