小时候，日向翔阳从电视上看见排球比赛，乌野高中的一名小个子在球上的英姿，简直就是个“小巨人”。他对此印象非常深刻，并开始迷上排球，一直想成为“小巨人”一样的人。
然而当他们举行完仪式，奇怪的事情发生了，教室突然猛烈摇晃起来，一阵巨响后地面轰然坍塌，所有人都掉了进去。 等他们醒来后，发现自己身处一个古旧的小学校舍里，这所废弃学校门窗紧闭，恐怖诡异。直美发现了昏迷的世以子，二人随后一起行动，企图离开这个可怕的校舍。但是更可怕的事情在后面等着她们，受害者一个个地出现。在这所名为“天神小学”的古老学校里，究竟是谁操控着这一切……
忠臣元禄秀吉的事迹已经流传了几个世纪。在47名烈士中，寺坂义文（佐藤宏饰演）是世界上唯一幸存的人。他受大岛秀吉（加藤仁作饰演）的委托，向世界传播47位烈士的事迹，肩负起照顾逝者的责任。时光飞逝，16年一眨眼就过去了。
