50年前,打算成为真正怪物的犬夜叉为了获得四魂玉,遇到了强大的精神女巫桔梗。在一起呆了一段时间后,两人发展了关系。犬夜叉因此希望成为人类,桔梗也计划在净化四魂玉后回归普通生活。然而,对桔梗怀有邪恶想法的偷蜘蛛将自己的灵魂和身体交给了怪物,然后转世成为邪恶的半恶魔奈良。在他的唆使下,犬夜叉被桔梗封印在神木上,身受重伤的桔梗也在悲伤和绝望中死去。桔梗转世的卡格救了犬夜叉,但不小心把四魂玉射成了碎片。为了取回碎片,她和她的同伴,包括七宝、弥勒、珊瑚,以及犬夜叉一起踏上了一段充满困难和障碍的旅程
2048年,经过中央政府管理的人工智能筛选,一部分人类登上星际迁徙飞船“阿拉姆”,前往11.9光年外的鲸鱼座τ星E的旅程。然而,人类花了20年时间到达的这颗行星与地球之间的环境差距远超预期,使其不适合人类生存。移民飞船上有一个叫庆雄的年轻人。4岁时,他目睹了自己的父母被哥斯拉杀死。20年来,他一直想回到地球,摧毁哥斯拉。移民的可能性已经消失,飞船内部的生活环境变得越来越恶劣。以Haruhiro为中心的“重返地球派”已经成为主流,他们决定通过危险的长途子空间航行重返地球。然而,经过2万年的进化,地球已经形成了以哥斯拉为顶点的生态系统,完全成为了一个未知的世界。人类最终能夺回地球吗?庆雄的命运会怎样?