电影版《新世纪福音战士》的第一部。它分为两部分:“死亡”和“重生”。“死亡篇”是根据动画电视原版第1集至第24集的内容改编的,其中一个总结章节经过了重新编辑。
这部电影告诉了山口组的两名成员Shimichiro(铃木信一饰演)和Yoshihiro(久石义弘饰演)调查未决案件的故事。三年前,当一郎呼吁对尚未解决的问题进行重新调查时;小丑案;在失踪案中,他被指派调查另一项完全不同的任务。
小新的失踪令美伢(楢桥美纪 配音)和广志(藤原启治 配音)感到十分焦急,就在此时,一名代号肌肉(玄田哲章 配音)的男子出现在了两人的身边,很显然,肌肉知道小新的下落和整件事情的来龙去脉,但肌肉并不愿意带着美伢和广志去寻找小新。追寻着细微的线索,美伢和广志得知小新身在香港,两人前往香港,在那里又遇见了肌肉,一行人前往神秘组织“猪蹄组”的老巢。