一次偶然中,一位名叫斋藤归蝶(上原明里 配音)的14岁少女从战国时代穿越到了现代,因为误将织田信永的名字认为了织田信长,于是坚定的决定履行和他之间的婚约。之后,织田信长的侧室生驹吉乃(小泽亚李 配音)也转生来到了信永的身边,信永左拥右抱的梦想似乎就要实现了。但一切都不是看上去的那么简单。
可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的威胁时,有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。 在那场传奇的战斗中,「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒,成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界,然后却突然消声匿迹了,而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播,成为了传说。 而现在,作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作,为了寻找过去发生的某件事件的真相,对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机,命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身,「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的,以及隐藏在游作过去的真相到底是——— 所有的答案,都在「Link Vrains」中