也许正是对尸体、骨骼那有着近乎偏执的异乎寻常的喜爱,让樱子接二连三卷入各种匪夷所思的死亡事件中。在此过程中,普通高中生馆胁正太郎(榎木淳弥 配音)也被樱子牵着鼻子跑来跑去,见证着每一个案件被侦破的瞬间。对于死者来说,恰恰因为有了樱子这样的怪人,才让他们的冤屈得以昭雪…… 本片根据太田紫织的同名轻小说改编。
故事发生在日本江户时代,当时一名神秘男子出现在武士桂(石田明配音)面前。他手里拿着魔剑“红樱”,要求对其进行测试。当晚之后,桂的下落不明。桂的宠物伊丽莎白(高松伸树配音)从万石屋找到了信高(Naomiya Rihui配音)和信矢加(Sakaguchi Daisuke配音),并委托他们寻找主人的下落。与此同时,银石(杉田智和饰)也被委托寻找调皮捣蛋的红樱的下落。三人的线索聚集在一艘飞艇上,由于远离警方的管辖范围,飞艇内的邪恶势力被完全隐藏起来。在那里,银石遇到了他的前战友、现任对手高崎信三(由齐安武史配音),他正带领他的幽灵军队试图摧毁江户。一边是令人发指的恐怖分子,另一边是残忍嗜血的妖刀红鹰。身受重伤的银石能否安全逃生,拯救江户?这部剧场版翻拍了《银魂》动画中的《红樱物语》,没有出现在原作中的真选组也将在故事中展示他们的技巧。