2004年圣诞节前夕,在一间高档公寓里,野口信弘(东井义史饰演)和他的妻子娜约子(小林直美饰演)双双遇害。现场有四名惊慌失措的年轻人:杉田秀美(容仓直美饰演)、成濑真司(和田正雄饰演)、安藤旺(加贺贤治饰演)和西崎真三(小林敬辅饰演)。
以海贼王为目标的少年蒙奇·D·路飞,将索隆、娜美、乌索普、山治、乔巴、以及Nico·罗宾加入了新的伙伴,继续航行。这时,在他们身边,巨大的船从天空落下。路飞们避开掉落的船,得救了。
传说中的部队——创形者队拯救了EL潜行者的第2次志愿者联盟战已经过去两年。 曾经的战场——高达模型联网对战(GBN)在经过版本升级后,加入了感觉反馈功能,代入感也得到进一步提升。不过也有很多潜行者并非出于跟风,而是怀揣各自想法进入这一世界。