在日本江户时代，水马龙吉原吉川（Yoshihara Yoshikawa）与艺妓熙熙攘攘。商人和亿万富翁花钱如粪土，只是为了赢得美女浅浅的微笑。只有八岁的时候，这个小女孩来到了吉原裕居，取名为清正。
娇小害羞的千濑（前田亚季 饰）一直暗恋着同班同学修次（洼冢俊介 饰），终于，在鼓起勇气向修次表白之后，千濑和修次之间纯白的爱情之花绽放了。一天，札幌的上空突然飞来了大量的轰炸机，战争开始了，也就是从那时起，修次发现了深藏在千濑体内的秘密——向来人畜无害的千濑竟然被军方残忍的改造成为了“最终武器”。 尽管心中充满了恐惧与不忍，但只要遭到了攻击，千濑的身体就会不受控制地做出自卫反击，就这样，在短暂的幸福之后，千濑绝望而又无助的，作为兵器的余生开始了。看着身体和心灵都千疮百孔的女友，修次无法说出宽慰之语，他只能通过行动，默默的陪伴在千濑的身边。
远山金次（间岛淳司 配音）是武侦高中里的一名平凡男生，他就读于侦查科，成绩属于最低等的“E”级。然而，金次有着不为人知的特殊能力，那就是在亢奋状态下，他的所有能力都会以30倍的数值快速增加，这种能力曾经为金次惹过不少的麻烦，因此他宁愿将其隐藏起来，做一个不起眼的普通人。一场突如其来的爆炸让金次结识了名为亚里亚（钉宫理惠 配音）的超强少女，金次的命运因为这次相遇而发生了翻天覆地的变化。
