《屠杀器官》的舞台将设定在赛拉耶佛核爆后的地球，此时部分落后国家爆发了一连串内战及民族冲突，在这血腥风暴之中，美国特殊情报部队「克拉维斯（クラヴィス）」发现了在阴影之下有一名叫「约翰?保罗（ジョン?ポール）」的美国人参与其中，约翰路过之处必定掀起腥风血雨，这让众人疯狂的 「屠杀器官」到底是什么？ 剧场版动画《屠杀器官》根据早逝的天才科幻小说作家伊藤计划的同名小说改编，由富士电视台的noitaminA节目企划，manglobe制作，将于2015年10月上映。
由于过去的心理阴影，以孤独和尴尬的思维循环称赞自己“独自生活”的山本碧奇古，被生活指导老师平祖静带到了“服务部”，并因意外事件加入。他每天都在解决各种案件，从解决课堂上的人际关系问题到文化节执行委员会的运作，与同一俱乐部令人窒息的完美美女雪芝夏雪和上流社会的时尚女性玉碧彬洁仪一起。直到秋天，像柴田这样的二年级学生都进行了一次学习旅行。在这一点上，服务部门收到的佣金是多少！？随着新推出的单色羽毛的加入，它们的关系变得更加复杂——柴田的空值也发生了轻微变化。经历了这些之后，他的高中生活将如何重新展开！？
