悲伤的爱德华和阿方斯兄弟试图用炼金术的最大禁忌——人体炼金术来拯救他们死去的母亲,但他们遭受了巨大的灾难。阿尔方斯失去了自己的身体,他的灵魂被盔甲囚禁,而爱德华则以右臂和左脚为代价,迫使他的弟弟停在黑社会的门口。武藏只能把自己的梦想藏在心里,直到有一天他遇到了人类被鬼魂残忍杀害的场景。武藏为了重新获得与小次郎的誓言,挑战了强大的鬼魂!