在一个漆黑的夜晚，一名间谍悄悄潜入日本警察局，从记录了各间谍机构重要数据的绝密文件中窃取了绝密数据。日本警方和联邦调查局特工赤井水一（池田秀树配音）立即追捕这名间谍。最后，逃犯的车从悬崖上掉了下来。
由“国家组织CIRS”新设的特殊技能训练校“美滨学园”……因各种原因失去归所的少女们被交付的是，枪与实弹。使用手枪的玲奈、擅长狙击的桐花、炸弹与信息处理的克莉丝、负责谍报活动的忍者邑沙季。
小田切双叶（金泽舞 配音）个性活泼开朗，有着超级旺盛的食欲的她曾经在数家店面里创下过大胃王挑战的记录，双叶不仅仅爱吃，在烹饪上也是一把好手。叶山照（今村彩夏 配音）表面看似成绩优异的乖乖女，实际上却有着非常腹黑的一面，每一天都在扮演着好学生的角色。这三个名字里都有“叶”的女孩成为了朋友。
