アニメ最新シリーズは、武内直子先生による原作コミックス完全版第5巻・第6巻の第3期<デス・バスターズ編>を映像化するもので、セーラー戦士と、謎の組織 デス・バスターズとの戦いが描かれています。
神秘的EVA Zero飞行员Ayanami在与Ikeyamura达成协议时,抵达了NERV底层的中央教条红池。她的命运似乎要在这里结束了。在关键时刻,川上和美不仅要按照吉信吉的指示完成对“第二次大灾难”和“人类完成计划”真相的调查,还要保护东和秋原,以及防止SEELE与第一架和第二架飞机的身体接触。出于对池原都的仇恨,秋原接受了SEELE引爆MAGI的提议。她能成功吗?为防止人类“终极悲剧”而酝酿的“人类完成计划”,比如与SEELE合作了很长时间的池云田、冬月耕、池吉,能否实现?请在电影《新世纪福音战士》第二部中提供答案。
在负责押送尸魂界王族秘宝“王印”的途中,一股神秘力量突然袭来,十番队虽奋力反击,却终究丢掉秘宝,日番谷冬狮郎(朴璐美 配音)也在阵前莫名逃亡。