三成美琴（石原龙美饰演）是一名在民间法医组织“UDI”工作的女法医，该组织专门接收因异常原因死亡的尸体，并对其进行解剖以查明案件真相。与美琴合作的还有法医中田实（井浦信饰演）、录音师京部龙郎（和田正雄饰演）和检验技师西子德海林（石川茂饰演）等。虽然中肠科有着丰富的临床经验，但其性格却古怪古怪。梅琴和中殿之间往往存在着不可调和的矛盾，它们对正义和法律有着不同的理解。事实上，中殿里有一个不为人知的秘密。他的女友不幸死于一场“意外”，但各种线索向纳夫透露，是一名连环杀手夺走了她的生命。中殿坚定不移地留在UDI，无所畏惧，正是为了找到杀害女友的凶手。
在一个风雨交加的晚上，一伙神秘的人策马狂奔向下田村的方向，之后这个村子就爆发了一场瘟疫，所有的村民都死了。在望月番番主的首肯下，甲贺组众忍者前往该村调查，不料路上遇到一个刀枪不入的彪形大汉的袭击，只有忍女阳炎（筱原惠美 配音）在一个男子的帮助下虎口逃生。帮助阳炎的这个人 就是牙神兽兵卫（山寺宏一 配音）， 不久之后他中了那个大汉的埋伏，两人一场血斗，最后兽兵卫险胜。这时一个自称是将军手下公义的小老头浊庵（青野武 配音）出现在兽兵卫面前，原来被杀死的大汉是鬼门八人众之一，将军对头的手下，浊庵等公义一直在跟踪他们，但其他公义都被杀了，只有浊庵一直跟踪到这里。浊庵的连哄带骗加诡计，以一百两雇兽兵卫协助他掉查此事，而且据他说鬼门八人众的头是已经被兽兵卫亲手杀死的冰室弦马（乡里大辅 配音），难道死人还能复活？在与鬼门八人众的交手中，阳炎再次出现并且救了兽兵卫，但她说这只是为了报恩。真的是这样吗……
