地球即将毁灭，尼夫和阿斯托里亚都死了。。。为了拯救世界，剩下的伊卡洛斯带着樱井智慧树飞到了天空中的锡那普斯城。在美丽的天空中，伊卡洛斯回忆起过去的日子。。。和主人在一起的时间，每一天、每一分钟、每一秒，都非常快乐。。。
然而，随着体内携带者的呼唤，她逐渐暴露了自己的杀手本性，并被研究所逮捕入狱。八年后，露西逃离了研究所，但由于严重的脑损伤，她失去了记忆，成为了一个“白痴女孩”。此时，由于童年时期的一次重大打击，浩太也患上了选择性健忘症。两人再次见面，浩太以陌生人的身份收留了露西。穿插在他们断断续续的记忆中，故事逐渐走向两个极端。
