镇心镇的青少年年满10岁后，即可获得训练神奇宝贝的资格。一个名叫Kochi（松本丽香配音）的10岁男孩，以成为最强大的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上修炼之旅。小智因为早上睡觉迟到，差点失去了挑选神奇宝贝的资格。漂浮在东京湾上的人工岛被称为“远东法外特别区”，俗称“24区”。虽然在这个岛上长大的向太、兰和昂辉有着不同的家庭、爱好和性格，但他们是形影不离的朋友。然而，由于某种情况，他们的关系发生了重大变化。
