故事以TV版为基础，战斗所剩下的骑士只有六人：城户真司(龙骑)、秋山莲(夜骑)、北冈秀一(钢兵),浅仓威(王蛇),雾岛美穗(FEMME)和神秘的龙牙RYUGA。雾岛美穗成为 骑士的目的是要杀死浅仓为姊姊报仇，并令姊姊复活。
根据管理规定，没有控制器的人工智能开始将失去网络连接资格的人类排除在外。那些忘记了过去繁荣的人只能生活在管理体系的阴影下。这部作品的舞台设定在一个人类日益衰落的世界里。城市结构作为一个舞台的世界就像一座巨大的高楼或一座连接所有建筑的巨大城市。它们中的大多数被超级结构遮挡，形成阶梯状结构。由于建设者的失控，城市结构正在无休止地扩张，截至本故事发生时，至少达到了木星的轨道平面。根据执政党的描述，正是城市的无目标增长从根本上导致了影响世界的混乱。其结果无疑是人口密度的极端下降。由于分散在其间的纳米机器人的作用，确保了环境中涉及的城市结构的范围是无菌的，从而确保了生物病毒的消除。这一成就是通过网络球在正常运行期间向统治委员会发出的指示实现的。在同一作者的《BIOMEGA》和《DEADHEADS》的主要作品中，由强大病毒引起的传染病理论上不可能在这部作品中发生。从这些设置中可以推断，“感染”作为网络末端遗传因素的突变原因并不等同于其字面上的感染，很可能是由系统逻辑的差异引起的。故事大纲探索了乌海在拥有数千层的巨大楼梯城市中的游荡。该设备手持一个可以穿透所有物质的引力子辐射发射设备，在网络终端跟踪遗传因素。
一位名叫Ailian（萨曼莎·罗宾逊饰演）的新女性搬到了这个小镇。有着诱人的外表和一颗像小女孩一样简单的心，爱莲已经成为小镇上的一道美丽的风景线。从表面上看，爱莲是一个手工艺人，经常在家里制作各种五颜六色的药水和肥皂。
