故事发生在位于关东南部的川神市，春天来临，万物复苏，平凡的少年直江大和（神谷浩史 配音）来到了川神学园，准备在这里开始全新的校园生活。刚刚开学，校园里是一副欣欣向荣的热闹景象，在这里，大和会遇见怎样有趣的伙伴，又会发生怎样有趣的故事呢？ 活泼开朗，古灵精怪的川神百代（浅川悠 配音）、四肢发达，头脑简单的川神一子（友永朱音 配音）、温文尔雅，温柔大方的黛由纪江（后藤邑子 配音）、外冷内热，坚强韧性的椎名京（冰青 配音），心高气傲，绝不认输的克丽丝蒂安妮·弗里德里希（伊藤静 配音），围绕在大和身边的，正是这些性格迥异但同样善良正直的美少女们。
这部电影改编自2005年山口和山本俊一执导的科幻恐怖电影《人肉机器》，告诉人类与寄生在神秘生命上的怪物搏斗的故事。讨债人野田裕二是一个中年人，他甚至不能完成配额任务，即使受到上级的欺负也不敢说话。医生告诉他他得了癌症。
夏天来临之际，病情一直很平稳的由美，晕倒在了学校里，此时的上条恰恰好不在她的身旁。之后，由美休了学，决定前往轻井泽疗养。本来只是为了完成任务的上条，在和由美的相处之中渐渐的真心爱上了这个单纯烂漫的可怜女孩，但这段感情注定是绝望的，要以死亡来做句读。
