因此，具有特殊能力的“炼金术”被派往图书馆担任特务秘书，与转世作家作战，以对抗书中摧毁世界的“侵略者”，保护文学。
御茶水工业大学生早乙女和也，因恶友南原耕太郎的阴谋赠送的病毒CD发作、试图抵抗之下，居然莫名奇妙的连结到生化达因公司网站，还误订了生化娃娃（Cyber Doll，简称CBD）。快递员送来了生化娃娃小梅，开启了和也与小梅的故事。
2004年圣诞节前夕，在一间高档公寓里，野口信弘（东井义史饰演）和他的妻子娜约子（小林直美饰演）双双遇害。现场有四名惊慌失措的年轻人：杉田秀美（容仓直美饰演）、成濑真司（和田正雄饰演）、安藤旺（加贺贤治饰演）和西崎真三（小林敬辅饰演）。
