在未来的某一天,一对男女Retro(山口胜平 配音)和Pandy(本田贵子 配音)在一片荒野中醒来,却发现自己不但赤身裸体而且丧失了记忆。二人来到了东京闹市中肆意抢劫衣服和食物,经过一番大战后,两人被捕,并被投放到月球上的监狱“Dead Leaves”。 经过一段短暂的禁闭生活后,他们发现这座监狱是一所克隆工厂。两个看守员随意杀害克隆人,于是Retro和Pandy萌生了越狱的念头。Retro和Pandy轻而易举地解开了身上的锁,更不可思议的是,他们居然对这座监狱了如指掌。他们的真实身份究竟是什么?
一次偶然中,又兵卫结识了名叫真一(武井证 饰)的少年,让又兵卫感到吃惊的是,真一告诉他自己来自未来。受廉姬所托,又兵卫成为了真一的监护人,而春姬即将与大国大名大仓井高虎(大泽隆夫 饰)政治联姻。 镜头转回现代,真一的失踪让身为父母的晓(简井道隆 饰)和美佐子(夏川结衣 饰)十分焦急,追寻着真一留下的线索,晓和美佐子也穿越回了古代,在那里,他们找到了真一,一家三口成为了春日城的座上客。
为了应对Guyadi开发的完全独立的无人作战武器“Legion”的入侵,其邻国圣诺斯替共和国开发了无人作战武器的破坏力。然而,无人战斗机只是一个空洞的名字,实际上是不被承认为“人类”的人——86名飞行员,被用作道具。