双亲很早就过世了,水原凉带着妹妹明钟住在简朴的公寓中。 突然有一天,从天而降一位神秘的美少女益田西守歌,她率领着一个黑衣军团,自称是水原凉的未婚妻。这是在人体内。在这个世界上,许多细胞都在努力工作。在某一天,白细胞(中性粒细胞)和红细胞遇到了含有迷路乳酸菌的普通细胞。为了将乳酸菌护送到它们的同伴身边,白细胞(中性粒细胞)和正常细胞向肠道出发。