U.在C.0097年期间,“拉普拉斯事件”的争端结束后,戈达德号这两只独角兽被秘密封存,新义勇残余党的“臂章”也随之解体。就在人类逐渐走出战争阴影之际,失踪两年的独角兽3“凤凰”突然出现了。Yasaka Yi(由Buko配音)是一个普通的年轻人,每年夏天都睡在祖父海边的老房子里。今年注定是非同寻常的一年。在方舟咖啡馆,Ayi遇到了他一见钟情的女人——Lan Shan Lan(由白石良子配音)。