此版《源氏物语 千年之谜》由鹤桥康夫执导,不仅使用CG,还加入动作场面和科幻效果,制作费用高达十亿多日元(折合人民币7千8百多万),于2011年12月10日在日本全国公映。
地球上,警员我贺伦追捕连续杀人犯追音香衣,后者被迫躲入女厕并劫持了一名人质。正当我贺伦对胶着的情况左右为难之际,一位少女从暗处出现,开枪击毙了追音香衣。谁也不知道,这两件看似无关的事件,有紧密的关联,宿命的轮盘开始转动。
在米娜就读的第一年Q班上,有很多来自米娜的朋友——过于活泼、经常暴力的森洋子(本田雅子配音)、经常陷入对同性关系幻想的艺术女孩长野原(森美穗配音),以及沉默安静、内有黑舌的外表,三个好学生的水麻衣服(由藤美穗配音)。就这样,经常线下的日常生活和激烈吐槽在三个人之间展开了。