在不久的将来,东京将成立两个主要组织来夺取“最强武器”:旨在开发最强武器的制导重工业和操纵遗传因素创造优秀人类的NSWF。他们的共同目标是获得终极武器“WITCHBLADE”,该武器拥有最强的力量,只能由选定的女性操纵。地震发生六年后。。。
某一日,一个名为莉柯丝(石见舞菜香 配音)的少女被一位名叫查克罗(花江夏树 配音)的少年发现在了废墟之中,当男孩遇见女孩,命运的齿轮开始了转动。 莉柯丝开始了在泥鲸的生活。德高望重即将成为下一任领导人的斯沃(岛崎信长 配音)、对岛屿外的世界充满了好奇的奥尼(梅原裕一郎 配音)、天真可爱不谙世事的萨米(金元寿子 配音),在岛上,每一段相遇都会交织出一段新的乐章。