对此感到焦躁的日本政府为了解决突然出现的Phenomenon而组织了特殊部队。总务省情报管理厅管辖扩张现实特殊战略队群特别攻击队——又名扩张少女系三重奏。
具备高超的实力但总是拒人于千里之外的美里良夜（石川界人 配音）、温柔可靠，课余兴趣是栽培盆栽的副社长筑馆敬助（近藤隆 配音）、社里唯一的正常人女川长吉（下野纮 配音）、外表看上去有点吓人但性格十分细腻善良的亘理光太郎（神谷浩史 配音），和这些可靠的前辈们在一起训练，翔太郎虽然对艺术体操一无所知，但凭借着自己的天赋和努力的汗水，他迅速的成长着。
果不其然，半途插班的日和无法很好的融入班级。但幸运的是，日和遇见了名叫广濑结心（铃村健一 配音）的少年，在结心的帮助下，个性强势又认真的中野律花（藤田咲 配音）和外表帅气人气极高的相泽夏辉（三瓶由布子 配音）接连出现在了日和的身边。更重要的是，在相处的过程中，日和逐渐的喜欢上了阳光开朗的结心，害羞的她能够向结心坦白自己的感情吗？
