在艾伦和他的同伴居住的帕拉迪岛之外，还有一个其他人类居住的世界。其中一个国家“马雷”爆发了与其他国家的战争。在一场激烈的战斗中，他们决定进攻帕拉迪岛，夺取“祖先巨人”。
美国和日本之间的战争爆发了，14岁的清太和她的妹妹四处逃亡。当他们到达避难所时，他们的母亲受了重伤，很快就去世了。从那时起，这两个兄弟姐妹过着相互依赖的生活。他们不得不求助于母亲的姐妹。
住在踯躅台的高中1年级生响裕太，某天醒来后失去了记忆。 之后，裕太与旧电脑里显现出来的“Hyper Agent·古立特”相遇了。 古立特告诉裕太“去完成使命”，而裕太则开始寻找这番话的意义以及自己的记忆。
