恐怖大王的威胁消除了，本院寺有恢复了平凡的日常生活。 在这座寺庙，住着一位大学生森里萤一，与三位女神。一年前，萤一打电话错打到女神事务所，并与女神贝璐丹蒂开始了同居生活，之后贝璐丹蒂的两位妹妹也住进了寺庙。
新闻报道显示发生了网络恐怖袭击。故事的主人公是一位名叫Yashin Taichi的五年级小学生，他住在东京郊区的一套高层公寓里。为了准备周末夏令营，独自呆在家里，我的母亲和去了涩谷的姐姐靖国登上了一辆势不可挡的电车。为了救他的母亲和妹妹，太一匆忙赶往涩谷。当他到达车站站台时，一个不可思议的现象发生了，太一走向了数字世界！孩子们遇到了他们的伙伴数码兽，一起面对未知的“冒险”！
在一次意外中，家世日渐衰落的年轻人吉村信八（金田正弘饰演）遇到了万事屋的主人坂田义史（小栗·修饰演）和天女新若纪（桥本春娜饰演）。他们三个人成了朋友。他们共同的朋友桂小太郎（冈田正人饰演）无故失踪。经过调查，一个名叫冈田秀吉（新井宏饰演）的男子和一把名叫“红鹰”的恶魔刀浮出水面。冈田秀吉是前反野蛮武士高崎（高本刚饰演）的部下。高崎讨厌这个腐败的世界，并一直试图彻底摧毁它。随着红鹰的力量越来越强大，整个江户地区都笼罩在越来越厚的云层中。
