在第二季中,主人公七濑遥(岛崎信长 配音)以及好朋友橘真琴(铃木达央 配音)成为岩鸢高中三年级生,他们一方面烦恼着没有新人加入游泳部,另一方面还面临着毕业去向问题。同为游泳部成员的渚(代永翼 配音)和怜(平川大辅 配音),积极准备着全国大赛的训练。 与第一季相比,本季最大的看点,就是新角色山崎宗介(细谷佳正 配音)的登场。他是凛(宫野真守 配音)小学时代的好友,游泳实力强劲,转校归来加入了凛的游泳部。两个游泳部,两支接力队伍,在未来的全国赛上,会碰撞出什么样的青春水花?
日本科学技术大学的教授上田次郎(阿部宽饰)主攻物理学。他向全日本的超能力者发出挑战,“如果能在我面前证明超能力的存在,将获得奖赏”。这一广告,吸引了落魄的魔术师,曾经日本第一魔术师山田刚三的女儿,山田奈绪子(仲间由纪恵饰)的注意。
母亲要杀他,这个冲击让伊达京介觉醒潜在能力。在京介觉得失意时,岬真夜这个让人忍不住关怀的女子出现在他面前。两人关系越来越密切此时,迷的突变体军团「hospitaru」(ホスピタル)和巨大企业「桐原体」的战斗机器人军团突然向他们攻击,为的是京介的双胞胎妹妹 琉奈为了保护妹妹和她的分身京介使用变身能力奋战着......