高坂贤吾(林遣都 饰)是一个看上去非常阴沉的青年,因为患有非常严重的洁癖症,所以贤吾无法与其他人正常的交往,这让贤吾感到非常的痛苦。一天,一个神秘的男人找到了贤吾,交给了他一个特殊的委托,一位名叫佐薙圣(小松菜奈 饰)的女高中生因为患有视线恐惧症而不愿意去学校,神秘男子希望贤吾能够帮助这位女孩。 刚开始,阿圣对于贤吾的关注反应非常的抗拒,对他恶语相向,态度十分糟糕,但很快,与阿圣有着相似经历的贤吾就明白了,这种攻击性,只不过是阿圣自我保护的一种方式而已,这种方式他自己也非常的熟悉。渐渐地,贤吾和阿圣之间的距离渐渐靠近。
Ikashi Shinji,成为“第三次冲击”的罪魁祸首,变得像一个无用的人。。。真嗣还能振作起来吗?继2012年《福音勇士》新剧场版:Q之后,这部动画告诉了这个密封故事的续集。
三人回忆起小学时光,约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里,他们居然遇到了归国的松冈凛(宫野真守 配音)。意料之外的是,昔日战友凛性情大变,还对遥发起挑战,结果遥输给了他。 遥、真琴和渚决定成立游泳部,经过多番努力后,终于招募到了新成员龙崎怜(平川大辅 配音),他们以县大赛冠军为目标,进行紧张的集训。另一方面,凛所在的鲛柄学院游泳部也在为大赛作准备。他们约定,要在赛场上决一高下。充满激情和活力的游泳部,在这个夏天,开始了关于友情与青春的Free!故事。