魂兽激发了隐藏在阿游体内的一种特殊能力。阿优原本是一名魂兽使者,可以通过操纵魂兽获得强大的力量。然而,操纵魂兽也要付出相应的代价。在操纵魂兽的同时,阿友的灵魂也会被黑暗侵蚀。如果阿友的灵魂达到崩溃的边缘,他将完全被魂兽吞噬,不再恢复到人形。
麻衣所在的学校出现了谣传,说旧校舍被灵所诅咒。涉谷一也受到校长委托,来到学校调查。同时被叫来的,还有巫女松崎绫子、和尚滝川法生、驱魔者约翰·布朗和灵媒师原真砂子。一行人在展开调查之时,发生了种种事故,这究竟是何种力量在作祟? 事件解决后,涉谷一也邀请麻衣加入他的涉谷心灵研究所(即SPR)打工。SPR接受各种委托,对各类灵异事件展开调查。麻衣和涉谷他们不仅仅用自身超能力解决问题,而且还会用现代科学解释。
故事发生在未来世界,一种名为“巨大”的生命体凭空出现,将人类的命运带到了灭绝的边缘。此时此刻,世界各国联合起来发明了可以与庞格竞争的武器,而只使用这些武器的女孩名叫莉莉。