这个故事告诉了一位名叫小圆莉莉（马昌福美佳饰）的大学生，他被一场追捕狂潮所困扰。由于在家庭电子邮件中使用纸巾，她决定在一家房地产中介公司寻找新家。负责带领她参观的房地产经纪公司是第二宫的成员小岛智子。
日本防卫省特种部队的精英内岛维辰（木佩·希娜饰）向学生们介绍了这种怪物。他拥有20马赫的超高速，人类的普通武器对他没有任何影响。为了防止怪物在一年后阴谋毁灭地球，人类必须想办法消灭他。而怪物自愿担任E班的班主任长达三年，因此无能为力的学生承担起了刺杀怪物的责任。之后，学生们接受了内岛的严格训练，刺客碧姬（Kei饰演）、智能机器人自主思考固定炮塔（桥本春奈饰演）、转学生森荷里（Kato Keishiro饰演）和教官秋原明（Takashima Masahiro饰演）等强大对手也纷纷来到这个暗杀教室，离奇的“杀害老师”将面临无休止的暗杀行动。。。这部电影改编自松井有政的流行漫画。
