清静和宰(石来光宏配音)是一个善良而普通的年轻人。他的妹妹清静和叶(能藤美子配音)的去世永远改变了他未来的道路。袭击Heye的是一种被称为“NOVA”的外星实体。
上世纪中叶,漆黑阴森的湘南特别少年院二舍六房迎来了新的住客:因伤害罪和杀人未遂被捕的水上真理雄(小栗旬 配音)、强壮孔武的远山忠义(黒田崇矢 配音)、偷窃欺诈成性的前田升(朴璐美 配音)、有着异国英俊面容的横须贺丈(羽染達也 配音)、酗酒暴力的怪力男松浦万作(脇知弘 配音)以及狡诈精明的野本龙次(藤原啓治 配音)。黑暗的过去,悲伤的童年,让这群少年的未来充满绝望。幸运的是,二舍六房的前辈樱木六郎太(小山力也 配音)担当起教育少年们的责任,在芜杂的战后日本社会以及混乱黑暗的少管所内,樱木带着6名少年朝着光辉的梦想矢志不移前进…… 本片根据安部让二的同名漫画原著改编(漫画家柿崎正澄但当作画)。
電影版《來自深淵 深魂的黎明》很快將要在 2020 年 1 月 17 日於日本上映,官方特別為支持本作的粉絲製作了觀影特典,是將今年的愚人節企劃《マルルクちゃんの日常》以四個短篇動畫呈現,分為四週在正片之前上映。