《黑礁》第二季继承了第一季的故事内容，于2006年10月2日至12月18日在日本播出。
一场大火烧毁了初中生南云隆（山田美玲配音）赖以生存的公寓。此外，父亲不见踪影，一贫如洗的南云在茫茫城市中漫无目的地游荡，最终昏倒在街头。幸运的是，南云得到了一名女大学生和志敏儿（高桥智秋配音）的帮助。
在对其他维度一无所知的地球中，有一个相对不为人知的新偶像——中原小麦。当她在池袋的一个会议场所工作时，被命令追赶病毒但遭到袭击受伤的Mai Maru从空中坠落。被小麦抱着的麦丸感受到了爱的力量，把她的魔杖递给了小麦，解释了事情的真相。尽管麦对这一突如其来的事件感到困惑，但由于她对那些需要帮助的人简单而无助的性格，她一口气同意了。所以，除了扮演一个神奇的女孩，麦还必须扮演偶像，学校忍不住要去。麦成了一个忙碌的人。不管怎样，她能用爱的魔力拯救地球吗？收拾行李
