2019年的一个夜晚,新东京郊外的封闭高速公路上,暴走族团体正在公路上飙车。带头的少年,是一名叫做金 田的职业高中学生。 突然,街上出现了一位奇怪的矮个子男子,暴走族少年铁雄为躲避车祸连人带车飞出公路。正当金田要拿那位男子问罪之时,军队驾驶直升飞机赶到。将那位矮个男子与铁雄一起收押。 铁雄进入了一个陌生的地方,这里似乎在从事超能力的研究。而金田则在盘算如何营救铁雄。二人都不知道,他们的未来,因为神秘力量——阿基拉而已经开始了巨大的变化。
故事发生在御伽学园里,大神凉子(伊藤静 配音)是一个身材娇小但个性十分凶悍的傲娇少女。在学园中,有一个名为御伽学园学生互助协会的神秘组织,而大神正是其中的一员。
25岁时,一个仍然无所事事的年轻人,安维尔·良介(妻子和丈夫木崎饰)意外欠下了300万日元的债务,之后他被迫成为山冈佑治(松由康子饰)经营的货运公司的职员。虽然日薪高达5万日元,但运输的货物都是尸体等高风险“物品”。