故事内容延续第一部TV版攻壳机动队STAND ALONE COMPLEX的剧情继续发展。但TV版的2部作品与剧场版无甚联系，可以看做是两个平行世界里发生的事情。 这次TV版第2季的制作班底与第一部相同，同时剧情表达上和第一季一样，每话由不同故事构成，各自独立成章，却贯穿着同一条主线。在剧情上同时电影版导演押井守也参与了协力，不过电影版中凄凉的气氛没有在TV版第二季中体现。
原来竹青庄同时也是宽正大学陆上竞技部的总部，藤原不知不觉就成为竞技部的成员。灰二多年前右腿负伤，他一直渴望打入箱根马拉松大赛。为此，他四处物色具有出色资质的校友，除藤原外，这里还有喜爱搞怪的城家兄弟太郎（齐藤庆太 饰）和次郎（齐藤祥太 饰）、留级大王尼克（川村阳介 饰）、法学部高材生雪彦（森廉 饰）、漫画宅男王子（中村优一 饰）、猜谜王（内野谦太 饰）、非洲留学生木萨、以及神童（桥本淳 饰）。这10个性格各异的青年扭成一股绳，为了心中共同的目标全速奔跑…… 本片根据三浦紫苑的同名原著改编，被评为2009年电影旬报年度十佳影片。
