喜欢神秘事物的东树自然很快乐，但科罗的脑海里充满了入侵地球的事情。他们在那里发现了废墟，因为迷路了，但后来由于意外情况不得不逃离那里。但就在这时，东树看到一个女孩在一瞬间迷失了方向。抱着女孩的神秘感，东树和科若罗回到了东京。但就在这时，最强大的敌人出现在他们面前。它看起来和KERORO一样，但与KERORO不同的是，他想迅速彻底地计划入侵地球的黑暗KERORO。他率领部下CIBABA、DORURURU和MIRURU在世界各国发动侵略行动。与这一切作斗争的科罗队的命运是什么
巧合的是，与妹妹特尼特（佐佐木三泽配音）相依为命的杰（铃木大遥配音）在100年后来到了世界。杰震惊地发现他们以前的豪宅变成了一所学校。就这样，杰把自己的名字从匿名改为神功四高玛，开始在学校学习，同时寻找回到过去世界的方法。
每天，他坐在公寓四层的家中，给在外谋生的孩子们出谋划策，教育孩子们：“为了不再过那种非人的生活，要不顾一切去争取。”前田家的生活水平不断上升，然而有人却死于非命......
