2009年4月~6月に放送された人気TVアニメの完結編となる劇場版2部作の第1部。監督は「攻殻機動隊 STAND ALONE COMPLEX」の神山健治。
在他的葬礼当晚,一名神秘女子拜访了因病去世的大学教授平川诚司(小田贤二饰)的妻子,但没有人。之后,广川大学的校长也突然去世,新校长的选举引发了一系列的怀疑和矛盾。奇怪的事情变得越来越普遍,甚至在周围的垃圾堆里发现了尸体。
成九保高中棒球部的女经理宫田秀吉(川口春奈饰演)因病住院。尽管她为一支数千年来一直处于联盟垫底的球队负责,但秀吉仍然不断想念她。由于受到了Yukichi的喜爱,他的老朋友川岛奈美(由前田俊彦饰演)临时担任了球队经理。