《少年故事》讲述一名少年突然收到来自网络的召唤,而大批黑衣人开始对他展开围捕。《虚拟程序》展示了一对男女在虚拟训练程序中的片断。《世界纪录》描写一位短跑运动员在接近突破人类极限时终被系统牢牢控制。《超越极限》叙述因为系统错误,平静的街区中出现了一片超常区域。《侦探故事》描写一位侦探被步步引领着试图摆脱系统的桎梏。《矩阵化》讲述一只机器人被人类捕获并驯化的故事。《终极战役》记录了一艘飞船毁灭的经过。
从某一天起,隆基不再是一个人,而额外的“同伴”实际上是在他浴缸里寄宿的美人鱼若卡(由梅原裕一郎配音)。悲观短视的北科新木(津田健二郎配音)、不请自来的水母三国(花江夏树配音)、聪明的章鱼鹰巢(铃木代友配音)、反复无常的鲨鱼阿哈里。自从龙出现后,这些奇怪的海洋生物也开始陆续出现在龙的生活中。在这个过程中,龙姬和若谦之间的关系似乎变得越来越亲密。
时间来到最终决战的两年后,在本应已迎来和平的地球上,怪兽们再度倾巢而出。 与此同时,世界各地相继发生了各种入侵超古代遗迹的事件。而GUTS-SELECT(精英胜利队)也迎来了新的队长——时冈(中村优一 饰),众人开启了调查。