在绝望的情况下，无处可去的Satsuma遇到了一位名叫Akira Kuramura的老人（由Akio Otsuka配音）。这位好心的老人接受了相扑。仓流和他的孙女早美（Toyasaki Aisheng配音）过着相互依赖的生活。现在他们家又多了一个女孩，生活变得活泼起来。与莎玛一同出逃的还有无忧无虑、无拘无束的西朝日（藤原夏海配音）和她的双胞胎妹妹西雅町（鬼头明日配音）。女孩们不得不一步一步地面对紧迫的研究人员和她们错综复杂的背景。
之后，一个神秘的环保组织SKBE掳走了小新一家人，而为首的，竟然是双叶里的里长四膳守（山寺宏一 配音）。原来，四膳首是一位激进的环保主义着，妄图通过一种神秘的药物将破坏环境的人类全部都变成动物，而小新捡到的神秘液体就是还尚处于测试阶段的药物，四膳守准备将美伢和广志当做实验对象进行研究。在神秘女子维多利亚（后藤邑子 配音）的帮助下，小新一行人成功出逃，他们和春日部防卫队一起，决心破解四膳守的阴谋。
在这个世界上，存在着一种名为“怪灵”的生物。故事发生在弗塞亚学院之中，在那里，设立了名为“脑机能异常对策室”的机构，专门解决怪灵带来的危险和麻烦。
