愤怒的魔术协会派遣了刺客,但他们却遭到了召唤出的Servant的反击。对此感到焦躁的日本政府为了解决突然出现的Phenomenon而组织了特殊部队。总务省情报管理厅管辖扩张现实特殊战略队群特别攻击队——又名扩张少女系三重奏。帕尔斯是一个富饶而又强大的国家,百姓们在此安居乐业,国泰民安。然而,异教徒之国鲁西达尼亚的铁蹄踏破了帕尔斯的宁静,纷飞的战火烧毁了辛苦维系的和平。