这对普通人来说可能很难,但世界上没有什么难的,江武快乐的高中生活即将开始。生日那天,姜武接到一个女孩的电话,她自称是自己的“妹妹”,但他不知道这个妹妹是谁。在学校公园里,江武遇到了许多可爱的女孩,包括年级委员会成员何晨乃枝(石原夏枝配音)、沉默害羞的新雅(佐佐仓阿雅配音)和高智商女孩佐根龙也(蔡日高利配音)。江武觉得自己神秘的妹妹就藏在这些如花般柔软的女孩中间。
柯南、小兰等人理所当然也接到邀请,甚至电视台的人也兴师动众前来。随着时间的流逝,双方的对决悄悄展开。另一方面,恐怖组织红色暹罗猫也登上了飞船。此前不久,红色暹罗猫袭击了国立东京微生物研究所,并盗走一种致命的病毒。 本片根据青山刚昌的同名漫画改编,是该动画的第14部剧场版。