牙鬼との激闘から2年、それぞれの夢に向かって旅立った6人は好天の三回忌をきっかけに再び忍術道場に集まった。そこへ突如現れた牙鬼の残党を相手にお互い成長した姿を見せ合うように妖怪を倒していく天晴達。
21世纪,地球恢复了往日的平静,但此时,一颗陨石从宇宙中坠落,陨石上有一个人造的时间胶囊。地球和平联盟TPC的GUTS团队通过时间胶囊了解到,地球上将发生重大灾难。
这个宁静的山村已进入雨季。村里的老伐木工人安克彦(石锁光司饰演)是一个保守的人,与儿子关系紧张。在上班的路上,他为新任导演田边敬一(小栗旬饰演)和来自东京的副导演带路,这让他参与了一部僵尸电影的外景拍摄。