二海堂昶(小野大辅 配音)是个性格孤僻不爱上学的不良少年,在一次逃学的路上,昶遇见了一位行事神秘的黑衣男子。男子名叫白银(诹访部顺一 配音),他告诉昶,自己和昶有着不可分割的羁绊,并和昶约定晚上十时在校舍见面。人类为了解开「兰道夫症候群」的原因、获得异形的DNA情报以及丰富的地下资源,人们纷纷前往深渊之中。